Zarząd Centrum Duszpasterstwa Młodzieży Archidiecezji Lubelskiej stosownie do potrzeb duszpasterskich powołuje Metropolita Lubelski. Od września 2024 roku decyzją księdza Arcybiskupa Stanisława Budzika w skład kierownictwa CDM wchodzą: ks. Emil Mazur (prezes), ks. Mateusz Wójcik (wiceprezes) oraz ks. Łukasz Protasiewicz (członek zarządu).
Przedstawicielami wspólnot fomracyjnych przy CDM jest Rada Młodych. Powoływana jest ona na roczną kadencję przez księdza Arcybiskupa. Uroczyste wręczenie nominacji odbywa się podczas diecezjalnych obchodów Światowego Dnia Młodzieży.
Rada Centrum Duszpasterstwa Młodzieży składa się z księży towarzyszącym młodzieży w formacji. Jej członków nominuje ksiądz Arcybiskup. Zadaniem rady jest opiniowanie i wspieranie realizacji działań statutowych CDM oraz udzielanie głosu doradczego zarządowi.
Biuro to miejsce, gdzie krzyżują się drogi różnych ludzi: członków i sympatyków Centrum, wolontariuszy, studentów, uczestników pielgrzymek na Światowe Dni Młodzieży i do Taizé, dawnych przyjaciół i znajomych, członów KSM czy Oazy. Dlatego z reguły jest tu głośno i tłoczno, ale nie należy się tym zrażać, bo zawsze jest ktoś, kto pomoże i udzieli informacji. To tam należy szukać wszelkich informacji na temat możliwości zaangażowania w różne inicjatywy proponowane młodym.